微生物学超高通量测序

我们用的是Illumina高通量测序平台对整个微生物基因组和转录组进行测序。这项技术每次运行产生数亿个短读取，每天达到多个千兆基序列。Illumina技术使我们能够研究细菌的进化，发现改变表型的突变，并记录动态进化过程。

细菌全基因组进化

利用高通量测序技术，我们研究了细菌之间遗传物质的转移(Sorek等人，科学2007)，记录了细菌的基因组收缩过程(莫兰等人，科学2009)，并发现细菌基因组如何进化以应对噬菌体攻击(Avrani等人，《自然》2011年)．我们还利用短读测序技术开发了精确检测基因组中单个突变的方法(Wurtzel等人，2010年)．