生物学中最引人注目的过程之一是一个受精卵在短时间内迅速生长和细胞多样化，发育成一个完整的胚胎。然而，当这个系统中的基本单位(细胞)包含相同的遗传信息时，变异是如何实现的，这是我们小组努力解决的一个深刻而基本的开放问题。我们对单细胞转录和表观基因组技术的最新发展感到兴奋，因为这些技术可以捕捉到胚胎细胞在原生状态下多样化的出现，并最终解决。但是，我们认为，该领域的迫切需要是将描述性单细胞图谱与模型和方法相匹配，以获得对胚胎组织功能和调控的新理解。为了实现这一目标，我们综合了发育生物学、表观遗传学、计算生物学、显微镜学和单细胞表观基因组学的专业知识和想法。我们研究了从老鼠到兔子的哺乳动物模型，设计出可以稍后在人类模型上实施和测试的见解。在未来的几年里，我们希望继续从这些优雅而令人敬畏的胚胎中学习如何塑造和重塑细胞程序、表观遗传记忆和整体组织功能。
我们的研究项目的中心前提是，对胚胎细胞规格的完整理解需要整合三个主要的现象学信息层:(i)细胞状态随时间变化的自然流动。(ii)在3D胚胎空间中影响细胞规格的细胞外线索的总和和(iii)表观遗传组成塑造和记忆细胞内状态。
