了解来自即时3D环境的外部信号如何影响细胞承诺是该领域的一个主要公开挑战，需要综合来自多个学科的想法和专业知识。为此，我们正在开发新的方法，从单个胚胎细胞索引空间表观基因组学，目的是构建高度定量和相关的原肠形成的时空模型。为了研究胚胎生态位是如何在动态变化的空间环境中形成的，我们专注于哺乳动物中最基本的谱系决定之一-早期胚胎中的生殖细胞的规范。原始生殖细胞在有限的空间定位中的诱导表明了严格调控的外部线索的参与，我们正在努力通过计算建模、摄动系统和DNA、RNA和蛋白质水平的组合细胞标记来解开。最后，我们最喜欢的谱系间相互作用的范例之一是胎盘和胚胎之间的交叉对话，我们使用我们开发的用于控制体内谱系操作的系统进行研究，该系统具有来自单细胞的强大读数(见下文)。
