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一条鱼,两条鱼

三角裤

日期: 2018年3月13日
来源:
魏茨曼杂志第13卷

对于监测红海埃拉特和亚喀巴之间海湾的海洋生物学家来说,发育成成熟鱼类的微小幼虫的数量是生态健康的重要指标。但是,已知有500多种鱼类经常出没于该海湾的珊瑚礁中,而且混乱的水下水流控制着鱼苗的扩散,因此,直到现在,识别和追踪单个物种几乎是不可能的。

分子遗传学系的Rotem Sorek教授开发了一种新的“条形码”技术,使科学家不仅可以监测亚喀巴湾的幼虫种类,还可以监测每种幼虫的数量,在一年中的什么时候,在什么深度。与特拉维夫大学(Tel Aviv University)和本-古里安大学(Ben-Gurion University)的海洋生物学家合作,Sorek教授的新技术是基于幼虫基因组的测序。这两所大学之前的研究涉及在显微镜下检查幼虫并计算刺数。这项工作是在斯蒂芬和南希大以色列国家个性化医疗中心进行的。

为了收集相关数据,科学家们在墨西哥湾潜水,剪下成年鱼的鳍进行DNA分析。Sorek教授和他的团队随后使用“宏基因组学”技术将这种成年遗传物质与幼虫相匹配,最终实现了大约80%的鱼类物种的条形码。

“虽然最初的过程有点艰苦,但我们现在有了一个监测珊瑚礁生态系统健康状况的绝佳工具,其他珊瑚礁研究人员可能会效仿,”Sorek教授说。

Rotem Sorek教授得到了Abisch Frenkel促进生命科学基金会、Y. Leon Benoziyo分子医学研究所、欧洲研究委员会、Leona M.和Harry B. Helmsley慈善信托基金、Dana和Yossie Hollander结构蛋白质组学中心、Martin Kushner Schnur以及David和Fela Shapell家庭基金会G-INCPM临床前研究基金的支持。