准备提交样品
对于大多数应用，用户提供RNA或DNA，而该单元根据需要对样品进行特定处理，将标记的样品杂交到选择的阵列(由用户直接购买)，扫描阵列，图像量化和基本分析。高级分析不是由单位提供，但可以从生物信息学单位获得。
请携带您的样品和相应的提交表格，并填写所有详细信息:
总体概述
- 输入质量:样品纯度和质量是最重要的。“垃圾-进-出”规则适用于所有的分析和阵列。值得努力准备好的输入样本，以显著增加获得好结果的机会。高质量的输入材料是指DNA或RNA
- 完整(未降级)。这可以通过凝胶(RNA和DNA)进行测试;
- 260/280的比例为1.9-2.1的RNA，或1.7-1.9的DNA
- 260/230比值不低于1.5。这很重要——如果你无法达到这些数字，请咨询我们。
- RNA/DNA提取应使用任何对您的细胞/组织有效的试剂盒/程序进行。只要RNA/DNA符合标准，就没有具体的建议。如果您使用有机溶液提取(酚类)，请确保260/230比例较高，因为苯酚的残留会降低该比例并破坏任何下游反应。注意:输入材料的质量是用户的责任!由于输入材料质量低而无法成功贴标签的样品仍将收取费用!
- 除非另有规定，样品应在无核酸酶的水中提交。大多数提取工具都提供这样的水。
- 提交所有应用的1.5 ml试管样品。确保管子有很好的标签，而且标签很容易理解。
- RNA样本应在冰或干冰中提交，但不能在液氮中提交。
- 提交样品时，请打印相关提交表格，填写后随样品一起带来。没有表格，样品将不接受。*插入样本提交表格!
- 应用要求的量和浓度:当提交样品时，请确保遵循下面列出的规格。如需偏离这些数字，请先咨询我们。
Affy基因/外显子ST输入:总RNA总量:100- 250ng浓度:100ng /ul体积:最小5ul 260/280比值:1.8-2.1 260/230比值:最好大于2，不小于1.5
Affy 3’(使用IVT-Express试剂盒)输入:总RNA总量:500ng浓度:200ng /ul体积:至少4ul 260/280比值:1.8-2.1 260/230比值:最好高于2，不低于1.5
Affy miR输入:总RNA总量:1ug浓度:最低150ng /ul体积:最高8ul 260/280比值:1.8-2.1 260/230比值:最好高于2，不低于1.5
安ilent表达输入:总RNA总量:200ng浓度:100ng /ul体积:5ul 260/280比例:1.8-2.1 260/230比例:最好高于2，不低于1.5
输入:DNA总量:0.5-1 ug浓度:最小25ng /ul体积:最大20ul 260/280比值:1.6-1.8 260/230比值:最好高于1.5
输入:总RNA(不使用大小分馏或小RNA富集方案)总量:100ng浓度:50ng /ul体积:5ul 260/280比例:1.8-2.1 260/230比例:最好高于2，不低于1.5
TapeStation RNA输入:总RNA体积为3 μ l，纳米试剂盒为50-500 ng/ul, pico试剂盒为0.5-10ng/µl
TapeStation HSDNA输入:体积为3µl，浓度< 10ng/ul的DNA
RNA和DNA样品的浓度必须标准化在相同浓度的范围内。
我们建议为最终的过程[测序]准备样品，然后取样品进行TapeStation分析。
Fluidigm Real-Time qPCR输入:cDNA和引物对浓度:50ng/µl cDNA和50µM引物对体积:至少6µl(96片)
蓝色皮平-试剂和卡带由用户提供(可在Zotal Ltd)!
样品应在30 μ l TE缓冲液中:
最大负荷:10g剪切基因组DNA
2g限制性内切酶/PCR条带捕获
最小负荷:低单纳克，剪切基因组DNA
50 ng限制酶切/PCR条带捕获
光学灵敏度约。10-15ng单波段，限制
(Midori-Green卡带):片段、PCR产物或合成DNA片段
输入样本特征
当运行BluePippin时，输入DNA的特征会影响分离分辨率和产品回收效率。应遵循以下一般准则:
- 离子强度:样品的离子强度应低于缓冲液的离子强度(80mM单价离子)。高盐浓度会导致DNA迁移速度低于预期。
- 样本中的蛋白质:dna结合蛋白，如连接酶或聚合酶，可以影响分离过程中片段的流动性。蛋白质还可以通过增加DNA与洗脱模块后面的超滤膜的结合来减少DNA从洗脱模块中的回收。为获得最佳结果，样品应尽可能在加载前进行脱蛋白处理。
- 输入DNA大小分布:了解输入大小分布显然对编程精确的大小选择设置很重要。使用安捷伦生物分析仪对BluePippin卡带进行校准，以评估输入和产品大小，因此，为了获得最佳结果，输入大小分布应使用生物分析仪进行评估。对于低浓度样品，安捷伦HS芯片是非常有用的。